包莖、陰囊積水及隱睪癥
這些情況都是發生在男性生殖器官上，很少會造成疼痛，但還是在下面中予以討論，因為有時會需要外科手術治療。
1、包莖(包皮過長、包皮緊束)
大約70%的嬰兒在出生時都有包皮過長的情形，這表示包皮太緊，無法上翻露出陰莖頭。根據丹麥的統計數字，如果不治療，到了青春期這情況只有4%還存在。因此最好的方法就是什么都不做，除非男孩反復地在包皮處發生疼痛的感染并造成包皮因形成結疤而變得更狹窄。包皮如果被不當拉寬，又常有難以覺察且難以治愈的發炎，這樣的情形也可能造成包皮結疤而變狹窄。針對這種情況，醫生大部分會建議全身麻醉后以手術割短包皮(包皮環切術)來解決問題。詳細手術經過可以咨詢外科醫生或泌尿科醫生。
有時候，如果包皮的部分黏住陰莖頭，陰莖垢積存也可能形成化膿性發炎。包皮垢常常會自行脫落，或醫生會用球形頭的探針小心將其剝除。不過包皮和陰莖頭黏在一起的情形也有可能數年都沒有問題，也不需要任何醫療。我們建議在青春期或是當包皮垢明顯堆積時，才定期清潔陰莖頭。
其實早在嬰兒期，偶爾就會有性器官勃起的的情形，小男孩有時會覺得疼痛或有緊繃的感覺，青少年的勃起并不表示有自慰的情形，這種情況特別可能會在凌晨睡覺時發生。
2、陰囊積水
所謂陰囊積水就是指在睪丸上方或側邊有個充滿液體的鞘膜囊。在出生前，嬰兒的睪丸會從肚子經過腹股溝管進入陰囊，把腹膜(腹腔內的平滑內襯)一起往下拉。包覆在其中的睪丸可以上下“游移”。在腹膜凸出部分完全關閉以前，當受到刺激時，似水泡狀的殘留物可能會持續存在，而且可能充滿液體。
這些積水的癥狀通常會在嬰兒期自行消失，不需要去管它們，幫寶寶包尿布時不要壓到。如果學齡前兒童仍有積水的癥狀，常會進行手術治療，尤其當孩子同時也有疝氣需要矯正時。
3、隱睪癥
如果在男童的陰囊內摸不到睪丸，這種情況被稱為隱睪癥。另一種“伸縮性”睪丸的狀況是當孩子泡熱水時，睪丸會下沉到陰囊底部，而在較冷的環境下又會縮到上面去，此種癥狀不需要手術治療。至于其他情形則需要手術，并需由醫生來診斷。
在手術前，有些兒科或外科醫生會建議先采取荷爾蒙治療。因為這些荷爾蒙會刺激生殖器官，就像在前青春期自然發生的刺激一樣，這種療法也會造成情緒的改變，而導致激進的人格變化。雖然荷爾蒙療法真的可以使睪丸下降(至少在沒有器質性障礙的狀況下是如此)，然通常只能持續短暫的時間，還是免不了要手術。細胞組織會因此變松，有些醫生視之為好現象，因為會使手術較為容易。在大部分的案例中，小男孩的陰莖會變得比較大，在治療結束后也無法恢復到原來大小。所以我們并不建議在手術前采用荷爾蒙療法，因為它破壞了孩子荷爾蒙的濃度，對其身心發展產生負面影響。我們會比較建議在手術前采用人智學或順勢療法的藥物進行體質治療。如果沒有出現預期的效果，仍然可以采用手術治療。
以下是一些目前贊成或反對手術的論點：根據動物實驗及人類睪丸的相關研究，外科醫生認為隱睪癥最遲應該在兩歲前采取手術治療，否則之后可能會造成機能不全，影響的不只是單邊未降下的睪丸功能，也會波及另外一邊已降下的睪丸。然就另一方面來說，早期采用手術治療對孩子的身心會產生沖擊，其結果是難以預料的。此外，上述的研究也無法預估個別手術的成功。因此我們有所保留地建議，當體質治療到兩歲大仍毫無成效時，再采取手術治療。
