嬰兒疫苗是將病原微生物及其代謝產物，經過人工減毒、滅活或利用基因工程等方法制成的用于預防傳染病的自動免疫制劑。當人體或動物體接觸到這種不具傷害力的病原菌后，免疫系統便會產生一定的保護物質；當人體或動物再次接觸到這種病原菌時，機體的免疫系統便會依循其原有的記憶，制造更多的保護物質來阻止病原菌的傷害。目前嬰兒疫苗分為兩種，一種是減毒活疫苗，一種是滅活疫苗：
減毒活疫苗：病原經處理后毒性減弱，但保持了抗原性，接種后觸發一次輕型的人工自然感染過程，從而引起免疫應答，但不會發病。
優點：免疫時間長，所需接種的次數少，可以產生比較牢固的免疫力，且成本低；
缺點：安全性相對低，有可能在人體內發生逆行性突變而恢復毒性，引起不良反應。
滅活疫苗：用加熱、化學等方法殺死的病原微生物或提取、純化的病原微生物組分如復合亞單位、類毒素、多糖聚合物制成的滅活疫苗，既不會使人染病，又可以使人體產生抗體。
優點：安全性高，易保存，有效期長
缺點：免疫時間短，需多次接種，成本高。
我國使用的疫苗基本都是減毒活疫苗，而由于減毒活疫苗的“減毒性”，疫苗中的病原仍有微弱致病功效，若在人體內發生突變恢復毒性，則會給接種的孩子帶來不可磨滅的傷害。我國嬰兒疫苗除了技術上的不足外，在監管上也存在漏洞，導致嬰兒疫苗保管不當，因此出現了許多嬰兒疫苗后遺癥病理。
